基因检测是万能的吗?它的不确定性比你想象的还要高互联网+

雷锋网 2017-07-25 11:54
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导读

  第二代基因测序技术使得基因检测流行开来,  无法解释的基因突变我们都是突变体,约有5%的人发现他们的基因携带未知变异。

雷锋网(公众号:雷锋网)按:7月14, 华大基因 ( 行情 300676 ,诊股)在深交所上市,赢得不少关注,甚至引发了精准医疗概念股的连续上涨,整个基因行业又掀起一股飓风。但是,基因行业真的那么神乎其神吗?Facebook CEO在今年的哈佛演讲中还提到了通过修饰

  雷锋网(公众号:雷锋网)按:7月14,华大基因(行情300676,诊股)在深交所上市,赢得不少关注,甚至引发了精准医疗概念股的连续上涨,整个基因行业又掀起一股飓风。但是,基因行业真的那么神乎其神吗?Facebook CEO在今年的哈佛演讲中还提到了通过修饰基因的方式消灭疾病。这些都是可能的吗?一般人都无法自己解读检测结果,专业工作者的责任重如泰山。近日,大西洋(行情600558,诊股)月刊的一篇文章,深入了几个美国的案例,揭露了基因测序中存在的巨大问题。雷锋网进行了编译。

  遗传学能为医学带来更多的准确性、更全面的诊断和个性化的治疗,但是对于一些人来说,基因检测,反而给他们带来了更多的疑问。

  AnneMarie Ciccarella是一57岁的黑发女郎,她语速很快,带着明显的纽约口音。她认为她对乳腺癌已经了如指掌了。1987年,她的母亲被诊断患出乳腺癌,她的其他几个亲人也得了这种病。当医生在她的一个乳房中发现可疑肿块时,她立即寻求基因检测的帮助,以寻找两种BRCA基因上的突变。突变之中一个,有20%以上的可能与乳腺癌的家族遗传有关。

  Ciccarella以为检测的结果能给她一个交代。恰恰相反,检测只是在仅BRCA1和BRCA2中确定出了未知变异(VUS,雷锋网注:一种与疾病之间的关联还不确定的变异)。与引发疾病和良性肿瘤的致病突变不同,人们对这些遗传变异的了解还不足以指出它们是否与疾病有关。

  “我只知道人的基因会发生变异,在我家族中存在的癌症病例也让我相信我身上也有变异的基因。我不知道竟然还有这么多未知的情况,我什么结论没有得到,我抽了那么多血,得到的反馈却是一个大大的问号。”Ciccarella说。

  成千上万的人对他们的BRCA基因进行过检测,以在遗传上确定他们是否更易患上乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌和其他癌症。约有5%的人发现他们的基因携带未知变异。未知变异的比例要比其他类型变异的比例高得多:一项研究表明,近20%的基因检测结果,都是检测者携带了未知变异。

  导致疾病的遗传变异非常罕见,但这并不意味着所有罕见的变异都会引发疾病。那么我们是否应该改变我们处理基因检测不确定性的方式呢?

  纽约哥伦比亚大学的生物伦理学家Robert Klitzman说:“这里有很多的不确定性。”人们希望基因检测做到像怀孕检测一样,他解释说:“怀孕检测结果会告诉你,你是不是真的怀孕了。但基因检测相反,它更像是天气报告。”而大多数人都没有准备好面对这种不确定性。

  当科学家们对一组在一年前就获得了BRCA基因检测的妇女进行调查时,发现,得到不确定结果的妇女要比那些得到明确结果(即使结果显示致病)的妇女更加紧张和焦虑。一项后续研究表明,认为自己有更高的患病风险的人,对不确定结果的容忍度越低,更有可能长期承受巨大的心理压力。

  早在她的测序结果出来之前,Ciccarella的家族史就让她决定做双边乳房切除术了。对她来说,她是否会患乳腺癌的问题已经有了答案,并做了最坏的打算。但为了自己的儿女,她仍然希望得到些提示,好让他们知道他们是否有癌症的遗传风险。不过,和许多家庭一样,他们发现基因测序并不会为每个人都提供明确答案。

  无法解释的基因突变我们都是突变体。很久以前,使我们成为我们的30亿个DNA片段,像刻在纪念碑上的字一样,只发生微小变化。科学家曾经认为DNA突变,在很大程度上是有害的。

  直到20世纪末21世纪初,随着人类第一次进行基因组测序,研究人员才意识到,他们对突变的看法是错误的。基因突变并不都是罕见的并损害健康的,他广泛分散在人类基因组中。平均每个人携带大约400个特有的突变,但我们大多数人的健康并没有因此而受损。

  这挑战了遗传学的一些基本原则,以及科学家和医生们解释基因检测的方式。

  当瑞典医学中心的遗传咨询师Robert Resta在20世纪80年代末开始研究遗传检测结果时,只能识别出染色体异常或大量DNA的变异。当引入其他类型的遗传检测时,如用于检测CFTR基因突变导致囊性纤维化的方法,相关的解释仍然是简单直接的。因为大多数接受过CFTR基因测序的人都有囊性纤维化的临床病症,所以自然而然的,Resta相信,在该基因上观察到的突变是导致囊性纤维化的原因。然而,在过去几年中,基因测序的费用急剧下降,医生越来越倾向于在诊断早期要求进行DNA检测。随着更多的数据的收集,我们所携带的突变越来越多地被揭示出来。

  “事实证明,突变是种常态。在基因中发现突变才是正常的。这是一个思考人类基因组的全新方式。如果你没有发现突变,说明你的测序仪可能有问题,“Resta说。

  斯坦福大学遗传性心血管病中心的遗传咨询师Colleen Caleshu表示,当科学家通过对大量的基因进行单次检测也就是基因组检测时,几乎可以说,他们至少会发现一种未知变异。她补充道:“检测的基因越多,发现的变异就会越多。“我们的基因有许多的突变,大部分的突变都非常罕见,但罕见也就意味着它是不可解释的。”总而言之,对我们检测的东西,我们了解得还太少。

  第二代基因测序技术使得基因检测流行开来,以寻找可能与患者症状有关的一系列基因突变。但与此同时,这个不确定的灰色区域也不断扩大。Resta表示,在三种可能的结果中,致病、良性或不确定,致病的概率最小,但不确定的概率最高。

  如果临床医生难以解释遗传检测结果,对患者来说,这也是难以接受的。Yvonne Bombard在职业生涯中的最后几年,曾在多伦多圣迈克尔医院(St. Michael’s Hospital)担任基因组卫生服务研究员,旨在了解家庭如何理解基因检测结果。

  “很少有关不确定的结果对家庭的影响的研究,这项技术还太新了,”Bombard说。

  心理肿瘤学的一项小型研究调查了24名在基因检测中得到了未知变异检查结果的,已患乳腺癌或卵巢癌的妇女。研究发现,她们中的许多人对这种结果存在误解。虽然三分之二的人在三年后仍然清楚地记得,她们检测中检测到的变异是未分类的,但79%的人却将该结果理解为有较高的患癌遗传风险。而三分之一的人也根据这一结果对他们的医疗保健方案作出重大改变,这是Resta和Caleshu不推荐的。

  疑似遗传病儿童病患的家属也面临这类似的困难。Caleshu解释说,父母倾向于将没有归为“良性”的变异理解成他们孩子患病的原因。但是,她也表示理解,毕竟这些家庭苦苦追寻了那么久了,就想有个答案。

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